"Aucun retard ou annulation de vol inhabituel n'a été enregistré ce matin", a écrit l'agence américaine dans un communiqué publié sur Twitter.
Pas moins de 1 320 retards de vols et environ 115 annulations ont été enregistrés jeudi, à 18h30 GMT, selon le site de suivi des vols FlightAware.
Plus de 10 000 vols ont également été reportés mercredi, selon la même source.
Mercredi, l'Autorité de l'aviation civile américaine a ordonné aux compagnies aériennes de suspendre tous les vols intérieurs au départ jusqu'à 14h00 GMT pour vérifier les informations de vol et les normes de sécurité.
La Maison Blanche a déclaré que le président Joe Biden avait appelé le ministère des Transports à ouvrir une enquête sur le dysfonctionnement qui a perturbé le trafic aérien.
Dans ce contexte, l'attachée de presse de la Maison Blanche, Karine Jean-Pierre, a fait savoir qu'il n'y avait aucune preuve que la panne du système était due à une cyberattaque.